MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Z176003 chromosome

Total Repeats: 70701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014029	CTG	2	6	305	310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502111
2	NC_014029	TTG	2	6	387	392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502111
3	NC_014029	AACC	2	8	443	450	50 %	0 %	0 %	50 %	294502111
4	NC_014029	TGT	2	6	484	489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502111
5	NC_014029	TAA	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502111
6	NC_014029	CTT	2	6	626	631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502111
7	NC_014029	TCA	2	6	867	872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502112
8	NC_014029	TTG	2	6	885	890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502112
9	NC_014029	CTG	2	6	899	904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502112
10	NC_014029	TAA	2	6	934	939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502112
11	NC_014029	GTG	2	6	957	962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502112
12	NC_014029	CTT	2	6	979	984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502112
13	NC_014029	T	6	6	998	1003	0 %	100 %	0 %	0 %	294502112
14	NC_014029	AGC	2	6	1051	1056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502112
15	NC_014029	CGT	2	6	1060	1065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502112
16	NC_014029	GTT	2	6	1072	1077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502112
17	NC_014029	GTGC	2	8	1194	1201	0 %	25 %	50 %	25 %	294502112
18	NC_014029	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502112
19	NC_014029	A	6	6	1437	1442	100 %	0 %	0 %	0 %	294502113
20	NC_014029	ACA	3	9	1457	1465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502113
21	NC_014029	CAA	2	6	1506	1511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502113
22	NC_014029	CATT	2	8	1644	1651	25 %	50 %	0 %	25 %	294502113
23	NC_014029	ATTC	2	8	1758	1765	25 %	50 %	0 %	25 %	294502113
24	NC_014029	GCG	2	6	1878	1883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502113
25	NC_014029	TGG	2	6	2036	2041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502113
26	NC_014029	ATG	2	6	2065	2070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502113
27	NC_014029	ATG	2	6	2086	2091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502113
28	NC_014029	ATT	2	6	2139	2144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502113
29	NC_014029	TCT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502113
30	NC_014029	ATCA	2	8	2269	2276	50 %	25 %	0 %	25 %	294502113
31	NC_014029	TGC	2	6	2344	2349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502113
32	NC_014029	ACA	2	6	2354	2359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502113
33	NC_014029	CTG	2	6	2418	2423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502113
34	NC_014029	GCG	2	6	2537	2542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502114
35	NC_014029	TGG	2	6	2649	2654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502114
36	NC_014029	CTG	3	9	2657	2665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502114
37	NC_014029	TTTA	2	8	2762	2769	25 %	75 %	0 %	0 %	294502114
38	NC_014029	GCC	2	6	2787	2792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502114
39	NC_014029	ACC	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502114
40	NC_014029	GTTG	2	8	2815	2822	0 %	50 %	50 %	0 %	294502114
41	NC_014029	ATT	2	6	2874	2879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502114
42	NC_014029	ATG	2	6	2895	2900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502114
43	NC_014029	GCG	2	6	2906	2911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502114
44	NC_014029	TCA	2	6	3030	3035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502114
45	NC_014029	T	6	6	3067	3072	0 %	100 %	0 %	0 %	294502114
46	NC_014029	GCG	2	6	3125	3130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502114
47	NC_014029	ACTC	2	8	3148	3155	25 %	25 %	0 %	50 %	294502114
48	NC_014029	AAT	2	6	3183	3188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502114
49	NC_014029	TGA	2	6	3207	3212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502114
50	NC_014029	CCT	2	6	3223	3228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502114
51	NC_014029	CTGG	2	8	3241	3248	0 %	25 %	50 %	25 %	294502114
52	NC_014029	GCA	2	6	3376	3381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502114
53	NC_014029	TGG	2	6	3451	3456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502114
54	NC_014029	CAC	2	6	3475	3480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502114
55	NC_014029	AAC	2	6	3534	3539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502114
56	NC_014029	TGA	3	9	3540	3548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502114
57	NC_014029	T	6	6	3627	3632	0 %	100 %	0 %	0 %	294502114
58	NC_014029	TCC	2	6	3741	3746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502114
59	NC_014029	ATTC	2	8	3772	3779	25 %	50 %	0 %	25 %	294502114
60	NC_014029	GTT	2	6	3814	3819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502114
61	NC_014029	A	8	8	3884	3891	100 %	0 %	0 %	0 %	294502114
62	NC_014029	TGC	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502114
63	NC_014029	ACC	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502114
64	NC_014029	CAG	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502114
65	NC_014029	TGT	2	6	4014	4019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502115
66	NC_014029	GTT	2	6	4030	4035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502115
67	NC_014029	TTG	2	6	4046	4051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502115
68	NC_014029	TTG	2	6	4061	4066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502115
69	NC_014029	CCA	2	6	4081	4086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502115
70	NC_014029	GCCA	2	8	4113	4120	25 %	0 %	25 %	50 %	294502115
71	NC_014029	GAT	2	6	4122	4127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502115
72	NC_014029	TAAA	2	8	4132	4139	75 %	25 %	0 %	0 %	294502115
73	NC_014029	GTT	2	6	4168	4173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502115
74	NC_014029	CAG	3	9	4205	4213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502115
75	NC_014029	TGG	2	6	4217	4222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502115
76	NC_014029	TGGC	2	8	4262	4269	0 %	25 %	50 %	25 %	294502115
77	NC_014029	ATC	2	6	4301	4306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502115
78	NC_014029	GAT	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502115
79	NC_014029	CTGT	2	8	4470	4477	0 %	50 %	25 %	25 %	294502115
80	NC_014029	AGTG	2	8	4538	4545	25 %	25 %	50 %	0 %	294502115
81	NC_014029	TGG	2	6	4548	4553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502115
82	NC_014029	TGC	2	6	4560	4565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502115
83	NC_014029	TAA	2	6	4610	4615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502115
84	NC_014029	CAA	2	6	4643	4648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502115
85	NC_014029	TCA	2	6	4737	4742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502115
86	NC_014029	GAA	2	6	4751	4756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502115
87	NC_014029	GTA	2	6	4768	4773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502115
88	NC_014029	CTT	2	6	4784	4789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502115
89	NC_014029	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502115
90	NC_014029	TCAA	2	8	4890	4897	50 %	25 %	0 %	25 %	294502115
91	NC_014029	TGG	2	6	4908	4913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502115
92	NC_014029	TTC	2	6	4916	4921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502115
93	NC_014029	CTG	2	6	4971	4976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502115
94	NC_014029	CAG	2	6	4979	4984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502115
95	NC_014029	GCT	2	6	5060	5065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502115
96	NC_014029	CTT	3	9	5266	5274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502115
97	NC_014029	TCA	2	6	5329	5334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502115
98	NC_014029	GCG	2	6	5375	5380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502115
99	NC_014029	GGA	2	6	5406	5411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502115
100	NC_014029	TGC	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502115
101	NC_014029	TTCT	2	8	5518	5525	0 %	75 %	0 %	25 %	294502115
102	NC_014029	GAT	2	6	5535	5540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502115
103	NC_014029	GA	3	6	5917	5922	50 %	0 %	50 %	0 %	294502116
104	NC_014029	T	6	6	5974	5979	0 %	100 %	0 %	0 %	294502116
105	NC_014029	GTC	2	6	6008	6013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502116
106	NC_014029	AGG	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502116
107	NC_014029	TGG	2	6	6126	6131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502116
108	NC_014029	TGG	2	6	6145	6150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502116
109	NC_014029	CTT	2	6	6154	6159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502116
110	NC_014029	CGC	2	6	6223	6228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502116
111	NC_014029	TAT	2	6	6382	6387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502116
112	NC_014029	T	6	6	6437	6442	0 %	100 %	0 %	0 %	294502116
113	NC_014029	T	6	6	6464	6469	0 %	100 %	0 %	0 %	294502116
114	NC_014029	CGT	2	6	6579	6584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502116
115	NC_014029	ATT	2	6	6594	6599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502116
116	NC_014029	TTA	2	6	6614	6619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502116
117	NC_014029	CTT	2	6	6649	6654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502116
118	NC_014029	ACC	2	6	6784	6789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502116
119	NC_014029	ATT	2	6	6797	6802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502116
120	NC_014029	AT	4	8	6830	6837	50 %	50 %	0 %	0 %	294502116
121	NC_014029	GGT	2	6	6868	6873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502116
122	NC_014029	GGC	3	9	6910	6918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502116
123	NC_014029	TCG	2	6	7008	7013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502116
124	NC_014029	TTG	2	6	7031	7036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502116
125	NC_014029	ATT	2	6	7075	7080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502116
126	NC_014029	GTTG	2	8	7089	7096	0 %	50 %	50 %	0 %	294502116
127	NC_014029	TAT	3	9	7123	7131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502116
128	NC_014029	ACC	2	6	7133	7138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502116
129	NC_014029	GAT	2	6	7201	7206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502116
130	NC_014029	CGG	2	6	7248	7253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502116
131	NC_014029	AATG	2	8	7270	7277	50 %	25 %	25 %	0 %	294502116
132	NC_014029	ATT	2	6	7291	7296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502116
133	NC_014029	GTGTT	2	10	7332	7341	0 %	60 %	40 %	0 %	294502116
134	NC_014029	GGT	2	6	7426	7431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502116
135	NC_014029	GAT	2	6	7510	7515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502116
136	NC_014029	CGT	2	6	7521	7526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502116
137	NC_014029	TTAT	2	8	7592	7599	25 %	75 %	0 %	0 %	294502116
138	NC_014029	CCCA	2	8	7645	7652	25 %	0 %	0 %	75 %	294502116
139	NC_014029	A	6	6	7898	7903	100 %	0 %	0 %	0 %	294502117
140	NC_014029	ACC	2	6	8000	8005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502117
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142	NC_014029	AAT	2	6	8120	8125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502117
143	NC_014029	TGC	2	6	8151	8156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502117
144	NC_014029	CA	3	6	8158	8163	50 %	0 %	0 %	50 %	294502117
145	NC_014029	TGG	2	6	8381	8386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502118
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148	NC_014029	TG	3	6	8548	8553	0 %	50 %	50 %	0 %	294502118
149	NC_014029	GAT	2	6	8560	8565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502118
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152	NC_014029	CGC	2	6	8792	8797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502118
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154	NC_014029	CCCG	2	8	8866	8873	0 %	0 %	25 %	75 %	294502118
155	NC_014029	ATT	2	6	8889	8894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502118
156	NC_014029	GAT	3	9	8965	8973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502118
157	NC_014029	AGC	2	6	8982	8987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502118
158	NC_014029	ATC	2	6	9022	9027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502118
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162	NC_014029	TTA	2	6	9154	9159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502118
163	NC_014029	CGG	2	6	9203	9208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502118
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166	NC_014029	ATT	2	6	9517	9522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502119
167	NC_014029	T	6	6	9541	9546	0 %	100 %	0 %	0 %	294502119
168	NC_014029	GAT	2	6	9608	9613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502119
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237	NC_014029	TA	3	6	20111	20116	50 %	50 %	0 %	0 %	294502123
238	NC_014029	TCAC	2	8	20149	20156	25 %	25 %	0 %	50 %	294502123
239	NC_014029	AAC	2	6	20794	20799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502124
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241	NC_014029	AG	3	6	20931	20936	50 %	0 %	50 %	0 %	294502124
242	NC_014029	AGT	2	6	20977	20982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502124
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245	NC_014029	GCCC	2	8	21217	21224	0 %	0 %	25 %	75 %	294502124
246	NC_014029	AGA	2	6	21237	21242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502124
247	NC_014029	AAC	2	6	21296	21301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502124
248	NC_014029	GAT	2	6	21445	21450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502124
249	NC_014029	AT	3	6	21527	21532	50 %	50 %	0 %	0 %	294502124
250	NC_014029	GC	3	6	21597	21602	0 %	0 %	50 %	50 %	294502124
251	NC_014029	TAC	2	6	21616	21621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502124
252	NC_014029	CAG	2	6	21703	21708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502124
253	NC_014029	CAT	2	6	21713	21718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502124
254	NC_014029	A	7	7	21999	22005	100 %	0 %	0 %	0 %	294502125
255	NC_014029	GCAA	2	8	22064	22071	50 %	0 %	25 %	25 %	294502125
256	NC_014029	GAA	2	6	22111	22116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502125
257	NC_014029	A	6	6	22115	22120	100 %	0 %	0 %	0 %	294502125
258	NC_014029	AGA	2	6	22148	22153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502125
259	NC_014029	GTG	2	6	22211	22216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502125
260	NC_014029	ACG	2	6	22223	22228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502125
261	NC_014029	CAA	2	6	22270	22275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502125
262	NC_014029	GTG	2	6	22301	22306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502125
263	NC_014029	TGTT	2	8	22316	22323	0 %	75 %	25 %	0 %	294502125
264	NC_014029	AT	3	6	22332	22337	50 %	50 %	0 %	0 %	294502125
265	NC_014029	ATG	2	6	22346	22351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502125
266	NC_014029	TGT	2	6	22398	22403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502125
267	NC_014029	CTG	2	6	22411	22416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502125
268	NC_014029	AAT	2	6	22424	22429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502125
269	NC_014029	TTG	2	6	22951	22956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502126
270	NC_014029	CAC	2	6	22996	23001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502126
271	NC_014029	CTG	3	9	23064	23072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502126
272	NC_014029	AGT	2	6	23096	23101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502126
273	NC_014029	TGA	2	6	23129	23134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502126
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277	NC_014029	TGA	2	6	23261	23266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502126
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279	NC_014029	CTC	2	6	23474	23479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502126
280	NC_014029	ATA	2	6	23482	23487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502126
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282	NC_014029	TGGG	2	8	23542	23549	0 %	25 %	75 %	0 %	294502126
283	NC_014029	GTG	2	6	23599	23604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502126
284	NC_014029	TC	3	6	23651	23656	0 %	50 %	0 %	50 %	294502126
285	NC_014029	CTA	2	6	23668	23673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502126
286	NC_014029	AGAC	2	8	23677	23684	50 %	0 %	25 %	25 %	294502126
287	NC_014029	TGA	2	6	23705	23710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502126
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289	NC_014029	GAT	2	6	23730	23735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502126
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292	NC_014029	TTG	2	6	23857	23862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502126
293	NC_014029	CTG	2	6	23881	23886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502126
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303	NC_014029	ATC	2	6	24904	24909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502126
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373	NC_014029	CCCGA	2	10	31023	31032	20 %	0 %	20 %	60 %	294502131
374	NC_014029	A	7	7	31105	31111	100 %	0 %	0 %	0 %	294502131
375	NC_014029	GCC	2	6	31222	31227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502131
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380	NC_014029	CGGG	2	8	31432	31439	0 %	0 %	75 %	25 %	294502131
381	NC_014029	TTG	3	9	31440	31448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502131
382	NC_014029	TCG	2	6	31492	31497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502131
383	NC_014029	CGG	2	6	31550	31555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502131
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385	NC_014029	TTTG	2	8	31616	31623	0 %	75 %	25 %	0 %	294502131
386	NC_014029	CCAT	2	8	31636	31643	25 %	25 %	0 %	50 %	294502131
387	NC_014029	AAC	2	6	31666	31671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502131
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390	NC_014029	CGA	2	6	31793	31798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502131
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